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基于临床指南的糖尿病本体构建及语义检索模型

来源:糖尿病天地(临床) 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-02-14

【作者】:网站采编
【关键词】:
【摘要】:1 引言 据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)数据显示,糖尿病已成为继肿瘤、心脑血管疾病之后的第3大威胁人类健康的慢性非传染性疾病[1]。中国已成为全球糖尿病患者第1大国,

1 引言

据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)数据显示,糖尿病已成为继肿瘤、心脑血管疾病之后的第3大威胁人类健康的慢性非传染性疾病[1]。中国已成为全球糖尿病患者第1大国,约有1.1亿名糖尿病患者。据WHO预测,到2025年中国2型糖尿病患者将超过1.3 亿[2]。糖尿病的急、慢性并发症尤其是慢性并发症可累及身体多个器官,致残致死率非常高,严重影响患者的生存质量和预期寿命。因此提高糖尿病的诊治水平,实现早预防、早治疗、早达标已成为当前专家学者和医生的研究重点和方向。

传统的医疗实践中医生多以教科书的理论知识和个人临床经验为主,一些主观判断错误会导致误诊或漏诊。为提高医疗过程的严谨性及诊疗效果,临床指南(Clinical Guidelines,CG)应运而生,它是在循证医学的概念基础上提出,按照循证医学的方法开发,旨在优化患者护理的一系列诊疗指导意见[3],辅助医生做出符合患者病情的恰当处理和选择,从而提高医疗质量。但在实际应用中医生临床指南的利用率并不高,因为临床指南大多以文本形式进行保存,查阅起来比较耗时,且临床指南涉及众多医学专业知识,不便于记忆[4]。因此将文本型的临床指南电子化,提高其利用率显得尤为重要。

本体作为一种知识表达模型的方法,可以做到知识表达与计算机的统一和互操作,还可为语义表达提供支持并实现知识共享,是对医学领域知识进行整合和组织的一种有效方法,众多专家学者都尝试将本体应用于医学领域的知识表示。如李晓瑛等人利用PubMed数据库和一体化医学语言系统(The Unified Medical System,UMLS),医学系统命名法--临床术语(SNOMED CT)搭建肿瘤本体,以扩充肿瘤本体知识库[5];陈云志依托肝炎疾病知识库系统进行肝炎疾病本体构建并以此进行语义智能检索的探索[6-7];叶青、李博等人依据高血压临床指南构建高血压临床指南本体,以期实现诊断推理[8];刘何心利用医学主题词表尝试构建糖尿病领域本体模型[9];方芳等人利用本体技术构建中医糖尿病医案本体[10],更好地发挥中医医案的价值;S Elsappagh 等人参照开放生物医学本体(Open Biomedical Onotology,OBO)构建2型糖尿病治疗本体知识库,为患者提供最佳的药物和饮食等治疗方案[11];也有通过利用标准医学本体,提出一种基于模糊本体的案例推理框架并将其应用于糖尿病的诊断[12]。可以看出大多数研究主要集中在利用现有的一些词表知识进行相应本体的构建,再将其应用于疾病诊断和知识库建设方面,而基于权威临床指南构建领域本体并进行语义检索的探索研究较少。因此为充分发挥糖尿病指南的使用价值,使其更好地为临床医生提供决策支持,本研究以糖尿病临床指南为基础,利用本体技术将糖尿病临床指南知识进行数字化描述,构建基于糖尿病临床指南的本体库,同时在此基础上构建基于本体的语义检索模型,提出一种根据领域本体库和应用本体库将查询请求转换为查询本体以进行相似度匹配的方法,为糖尿病管理系统和检索系统的开发提供借鉴。

2 研究方法

本体是一种被定义为共享知识概念模型的明确的规范说明[13],能够对某一领域内的概念及其间的关系进行很好地描述。近年来本体技术被广泛应用于医疗领域[14-18],目前本体构建方法主要有7步法、骨架法、METHONTOLOGY法、TOVE、KACTUS工程法、SENSUS 法等[19]。本研究主要参考7步法和骨架法进行糖尿病本体的构建,同时根据研究领域的应用需求特点对方法步骤进行相应的调整和改进,最终确定糖尿病本体库的构建步骤主要包括:确定本体的专业领域和范畴、复用现有的本体、列出糖尿病领域中重要知识术语、定义糖尿病的类及属性关系、创建实例、本体的检验与评价。由于针对中国人群,因此选择中华医学会糖尿病学分会主导编制的《中国2型糖尿病防治指南(2013年版)》和《中国1型糖尿病诊治指南(2012年版)》为主要依据,以其他相关指南为辅作为参考。

3 糖尿病领域本体构建

3.1 确定本体专业领域和范畴

是构建本体的第1步,即明确本体所覆盖的专业领域、本体使用人员和应用本体的目的。基于临床指南的糖尿病本体主要包括糖尿病的诊断、分类、检查、治疗、并发症以及特殊人群的糖尿病等内容。基于临床指南的糖尿病本体是对糖尿病领域知识进行组织和管理,形成统一的描述化语言,应用于实际系统中。基于临床指南的糖尿病本体是为临床医生和相关科研工作者提供学习的工具,为医生在临床实践中的辅助诊断提供便利。

文章来源:《糖尿病天地(临床)》 网址: http://www.tnbtd.cn/qikandaodu/2021/0214/632.html

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